多下软件园小编给大家分享的ImageJ是一个用于图像处理和分析的开源Java工具,它是由National Institutes of Health开发的,可以在Windows、Mac OS、Linux和Sharp Zaurus等多种平台的运行,Image J基于强大的图片分析与处理功能,它广泛应用于生物医学、材料科学、物理科学等领域,在科研中的应用极为广泛。ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印8位,16位,32位的图片,支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多种格式,功能非常强大的一款细胞计数、灰度分析软件,欢迎有用到的朋友前来获取吧!
ImageJ特点
1、具有加载,显示和保存图像功能的用户界面。
2、图像处理,共定位,去卷积,注册,分割,跟踪,可视化等等。
3、一个强大的机制,以各种有用的方式扩展ImageJ。
4、通过脚本和宏自动,可重现的工作流程,包括远程服务器或集群上的无头。
ImageJ功能
1.ImageJ适用用户自定插件和宏。ImageJ内置在线编辑器,而且导进了java的编译器,完成了简易的IDE功能,用户可立即根据ImageJ开展图像处理。
2.主面由菜单栏,菜单栏和通知栏构成。
3.菜单栏包含:文档,编写,图型,解决,剖析,插件,对话框,协助。
4.文档关键有:文档开启,关掉,储存等功能,较为独特的一个功能是修复功能。能够立即返回之前储存过的情况。
5.ImageJ根据Java插件被设计方案为对外开放系统架构的,能够获得订制的剖析、解决插件,这种插件都可以应用ImageJ内嵌的在线编辑器和编译器。用户自定插件能够处理基本上全部图像处理和剖析层面的难题。
6.ImageJ的源码完全免费出示。
计算总面积
在Image J内打开目标图像后,将图片转换为灰度图片:Image →Type → 8-bit

调整阈值:Image → Adjust → Threshold进行颜色阈值选定。

调节颜色阈值选定(红色代表选中)所有脑片。

设置面积范围:菜单栏点击Analyze → Set Measurements

选择Area与Limit to threshold选项,测量阈值选定范围的面积

计算总面积:菜单栏点击 Analyze → Analyze Particles

设置低于此像素值的不计面积100、500、1000即可,500最佳 ;
Show选项下选择显示脑片轮廓,选择Outlines → 勾选所需要的选项:Display results(结果)、Summarize(汇总)、Exclude on edges(不计边缘) 、In situ Show (原位显示) ;
最后点击OK。

显示计算的面积区域以及得出各个区域的面积数值。

计算面积结果:总面积
计算缺血面积
设置阈值:重新打开图片,点击Image → Adjust → Color Threshold;

设置阈值:移动滑块,调整直至红色选中所有白色脑缺血区

计算面积范围:点击 Analyze → Analyze Particles

计算面积范围:设置低于此像素值的不计面积100、200即可,200最佳;
Show选项下选择显示脑片轮廓,选择Outlines,勾选所需要的选项:Display results(结果)、Summarize(汇总)、Exclude on edges(不计边缘)、 In situ Show (原位显示) ;
最后点击OK。

显示缺血区轮廓以及得出各缺血区面积。

计算缺血区面积:缺血区总面积。
计算缺血区面积百分比
TTC是脂溶性光敏感复合物,为呼吸链中吡啶-核苷结构酶系统的质子受体。TTC与政策组织中的脱氢酶反应呈红色,缺血组织内脱氢酶活性下降呈苍白色,如下图所示:

缺血区面积比=(各切片白色缺血区面积之和)/(各切片脑片面积之和)x 100%;
缺血区面积比 = 968491/1639434 x 100% = 59.07%;
ImageJ是一款功能强大、开源免费的图像处理软件,适用于各种图像处理需求。无论是科研人员、工程师还是图像爱好者,都可以从ImageJ中受益,实现自己的创意和需求。